Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP47Q96K76 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP47Q96K76 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP47Q96K76 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP47Q96K76 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP47Q96K76 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP47Q96K76 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
USP47Q96K76 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP47Q96K76 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms