Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A4AQ96JQ5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms