Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK5RAP3Q96JB5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms