Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHDQ96IW2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms