Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM46AQ96IP4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM46AQ96IP4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM46AQ96IP4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FAM46AQ96IP4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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FAM46AQ96IP4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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FAM46AQ96IP4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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FAM46AQ96IP4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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FAM46AQ96IP4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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FAM46AQ96IP4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM46AQ96IP4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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