Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SGSM3Q96HU1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM3Q96HU1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms