Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNF8Q96H20 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNF8Q96H20 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNF8Q96H20 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms