Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSANTD3Q96H12 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSANTD3Q96H12 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms