Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35A4Q96G79 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC35A4Q96G79 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms