Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RNFT2Q96EX2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RNFT2Q96EX2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RNFT2Q96EX2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RNFT2Q96EX2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RNFT2Q96EX2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNFT2Q96EX2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms