Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP36Q96EU6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms