Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
MALSU1Q96EH3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MALSU1Q96EH3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms