Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CMTM5Q96DZ9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMTM5Q96DZ9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMTM5Q96DZ9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMTM5Q96DZ9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMTM5Q96DZ9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMTM5Q96DZ9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMTM5Q96DZ9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMTM5Q96DZ9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMTM5Q96DZ9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMTM5Q96DZ9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMTM5Q96DZ9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMTM5Q96DZ9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMTM5Q96DZ9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMTM5Q96DZ9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMTM5Q96DZ9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CMTM5Q96DZ9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CMTM5Q96DZ9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms