Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RTP4Q96DX8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTP4Q96DX8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RTP4Q96DX8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms