Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC39Q96DD0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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