Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GCC1Q96CN9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCC1Q96CN9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms