Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EAF2Q96CJ1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms