Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VOPP1Q96AW1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms