Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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CCDC74AQ96AQ1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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CCDC74AQ96AQ1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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CCDC74AQ96AQ1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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CCDC74AQ96AQ1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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CCDC74AQ96AQ1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC74AQ96AQ1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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CCDC74AQ96AQ1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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CCDC74AQ96AQ1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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CCDC74AQ96AQ1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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CCDC74AQ96AQ1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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CCDC74AQ96AQ1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC74AQ96AQ1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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