Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UTP4Q969X6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms