Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEAL3Q969E4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEAL3Q969E4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEAL3Q969E4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEAL3Q969E4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCEAL3Q969E4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCEAL3Q969E4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCEAL3Q969E4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TCEAL3Q969E4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TCEAL3Q969E4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TCEAL3Q969E4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TCEAL3Q969E4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCEAL3Q969E4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCEAL3Q969E4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCEAL3Q969E4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TCEAL3Q969E4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TCEAL3Q969E4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TCEAL3Q969E4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TCEAL3Q969E4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCEAL3Q969E4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCEAL3Q969E4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TCEAL3Q969E4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TCEAL3Q969E4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TCEAL3Q969E4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms