Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD50Q92878 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD50Q92878 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms