Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHX38Q92620 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX38Q92620 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX38Q92620 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX38Q92620 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX38Q92620 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX38Q92620 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX38Q92620 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHX38Q92620 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms