Protein–RNA interactions for Protein: Q92393

TY1B-OR, Transposon Ty1-OR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-ORQ92393 UBP15YMR304W 3693 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 SNQ2YDR011W 4506 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 SEC26YDR238C 2922 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 RGR1YLR071C 3249 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 RPL13BYMR142C 600 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 TYR1YBR166C 1359 nt4.14□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 YRM1YOR172W 2361 nt4.13□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 YMR082CYMR082C 357 nt4.13□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 PAU14YIL176C 363 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 PAU1YJL223C 363 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 ANB1YJR047C 474 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 SSQ1YLR369W 1974 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 MHO1YJR008W 1017 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 RPL17AYKL180W 555 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 SFH1YLR321C 1281 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 TFB4YPR056W 1017 nt4.12□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 IZH3YLR023C 1632 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 RAM1YDL090C 1296 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 RPS22AYJL190C 393 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 PRE2YPR103W 864 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 YCL022CYCL022C 516 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 URK1YNR012W 1506 nt4.11□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 PET54YGR222W 882 nt4.1□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 YHR213WYHR213W 597 nt4.1□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 YAR062WYAR062W 597 nt4.1□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 YSH1YLR277C 2340 nt4.1□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 YIL163CYIL163C 354 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 PHD1YKL043W 1101 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 SDH3YKL141W 597 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 RBL2YOR265W 321 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 FZO1YBR179C 2568 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 DHH1YDL160C 1521 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 TDA11YHR159W 1515 nt4.09□□□□□ -1.75
TY1B-ORQ92393 VTC1YER072W 390 nt4.09□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 MNT4YNR059W 1743 nt4.08□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 APL6YGR261C 2430 nt4.08□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 RHO5YNL180C 996 nt4.08□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 DGA1YOR245C 1257 nt4.08□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 OSH2YDL019C 3852 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 HOS3YPL116W 2094 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 RTT103YDR289C 1230 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 YOR050CYOR050C 348 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 ECM2YBR065C 1095 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 GAT2YMR136W 1683 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 FMP25YLR077W 1752 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 PTI1YGR156W 1278 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 RSA1YPL193W 1146 nt4.07□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 BEM4YPL161C 1902 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 BCK1YJL095W 4437 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 SPO71YDR104C 3738 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 HPC2YBR215W 1878 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 NPR3YHL023C 3441 nt4.06□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 GRX6YDL010W 696 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 GCD6YDR211W 2139 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 MIC27YNL100W 705 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 SEO1YAL067C 1782 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 KRI1YNL308C 1776 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 PUT3YKL015W 2940 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 TSR1YDL060W 2367 nt4.05□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 RPL33AYPL143W 324 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 YBR242WYBR242W 717 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 RIB5YBR256C 717 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 AUS1YOR011W 4185 nt4.04□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 YDR061WYDR061W 1620 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 FCF1YDR339C 570 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 RRP46YGR095C 672 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 PSY1YKL076C 384 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 BET3YKR068C 582 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 IRC20YLR247C 4671 nt4.03□□□□□ -1.76
TY1B-ORQ92393 TRK1YJL129C 3708 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 YML119WYML119W 1074 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 FUN12YAL035W 3009 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 YLR152CYLR152C 1731 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 YDL241WYDL241W 372 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 SFH5YJL145W 885 nt4.02□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 RRD2YPL152W 1077 nt4.01□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 YDL124WYDL124W 939 nt4□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 MAF1YDR005C 1188 nt4□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 GRE3YHR104W 984 nt4□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 YKR033CYKR033C 426 nt4□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 END3YNL084C 1050 nt4□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 PTR2YKR093W 1806 nt4□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 GSM1YJL103C 1857 nt4□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 PMR1YGL167C 2853 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 LDS2YOL047C 1071 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 GIP3YPL137C 3831 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 MRPL37YBR268W 318 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 APL5YPL195W 2799 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 FMP33YJL161W 543 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 RPB8YOR224C 441 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.99□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 AYR1YIL124W 894 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 MSB1YOR188W 3414 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 CDC6YJL194W 1542 nt3.98□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 YLR352WYLR352W 2424 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 FRE1YLR214W 2061 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 SWP1YMR149W 861 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 MCA1YOR197W 1299 nt3.97□□□□□ -1.77
TY1B-ORQ92393 DIM1YPL266W 957 nt3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.3 ms