Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HERVK_113Q902F9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms