Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALLDQ8WX93 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms