Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKA2Q8WVK7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms