Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM0

NUP133, Nuclear pore complex protein Nup133, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133Q8WUM0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP133Q8WUM0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP133Q8WUM0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP133Q8WUM0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP133Q8WUM0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP133Q8WUM0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms