Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GADD45GIP1Q8TAE8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GADD45GIP1Q8TAE8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GADD45GIP1Q8TAE8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GADD45GIP1Q8TAE8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GADD45GIP1Q8TAE8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GADD45GIP1Q8TAE8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GADD45GIP1Q8TAE8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GADD45GIP1Q8TAE8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GADD45GIP1Q8TAE8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GADD45GIP1Q8TAE8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GADD45GIP1Q8TAE8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms