Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL2Q8NHH9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms