Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PJA1Q8NG27 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PJA1Q8NG27 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms