Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms