Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3C3Q8NEB9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms