Protein–RNA interactions for Protein: Q8N841

TTLL6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL6Q8N841 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTLL6Q8N841 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL6Q8N841 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL6Q8N841 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL6Q8N841 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL6Q8N841 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL6Q8N841 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTLL6Q8N841 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms