Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7U9

LINC00469, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00469, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00469Q8N7U9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms