Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHCHD4Q8N4Q1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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