Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDDC3Q8N4P3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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