Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CMTR1Q8N1G2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMTR1Q8N1G2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms