Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP3Q8IZU3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYCP3Q8IZU3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms