Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA2D3Q8IZS8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA2D3Q8IZS8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms