Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFT20Q8IY31 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT20Q8IY31 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms