Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RPAP2Q8IXW5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP2Q8IXW5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms