Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN4BQ8IWT1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN4BQ8IWT1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN4BQ8IWT1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms