Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC83Q8IWF9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms