Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KSR1Q8IVT5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR1Q8IVT5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms