Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A9Q8IVB4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A9Q8IVB4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms