Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALYREFQ86V81 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms