Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01551Q86U37 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms