Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCGF5Q86SE9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCGF5Q86SE9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms