Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBBP6Q7Z6E9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBBP6Q7Z6E9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RBBP6Q7Z6E9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms